وحدة تابعة للمؤسسة متخصصة في توثيق الاعتداءات على المواقع الأثرية، والرفع بالتقارير إلى الجهات الدولية والقضائية، تأسست كأحد مخرجات ورشة حماية المقدرات الأثرية.
يعمل المرصد على بناء قاعدة بيانات للمخاطر التي تهدد التراث اليمني، وتدريب المواطنين كمراقبين مجتمعيين، ونشر التوعية الإعلامية والدينية بأهمية حماية الآثار.
